Tabel

Stafprøver_2004


Beskrivelse ?

Tabel med modtagne isolater og tilhørende laboratoriesvar

Størrelse (Antal rækker) ?

108612

Indhold (Kolonner/variable) ?

Navn Indhold
PersonID linker til tabellen Persons, løbende nummerering
Fagnummer Nøglefelt, internt nummer på isolatet
Ønsket_undersøgelse Her kan angives hvilken undersøgelse, der ønskes
Lok_Prøvenr Isolatets lokale prøvenummer
Prøvedato Dato hvor isolatet/prøven blev taget
KMA Angivelse af den klinisk mikrobiologiske afdeling der har sendt prøven ind
KMA_TXT Tekst oversættelse af KMA. Findes kun i arkiveringsversionen
Hospital_PRL Angivelse om prøven er taget på hospital (med angivelse af hvilket) eller hos privatpraktiserende læge
Hospital_PRL_TXT Tekst oversættelse af Hospital_PRL. Findes kun i arkiveringsversionen
Afd_Ydenr Hvis kendt, den afdeling på hospitalet hvorfra prøven er taget/patienten er indlagt.Feltet kan indeholde numeriske og alfanumeriske værdier. Hvis felt Hospital er PRL, kan feltet indeholde den privatpraktiserende læges ydernr. Privatpraktiserende lægers y
Prøveart Angivelse af hvor på/i kroppen den indsendte bakterie er isoleret fra
Prøveart_Txt Tekst oversættelse af prøveart. Findes kun i arkiveringsversionen
Isolat_nr_Bakteriæmi Angivelse af hvorvidt isolatet er et nyt tilfælde af blodforgiftning med Staphylococcus aureus eller er taget tidligere end 30 dage efter det foregående isolat. Feltet består af et tal og et bogstav. Tallet angiver episoden, mens bogstavet angiver om prøv
Isolat_nr_Bakteriæmi_txt Tekst oversættelse af Isolat_nr_Bakteriæmi. Findes kun I arkiveringsversionen
Isolat_nr_MRSA Angivelse af hvorvidt isolatet er et nyt MRSA tilfælde. Feltet består af et tal og et bogstav. Tallet angiver episoden, mens bogstavet angiver om prøven er af samme subtype. 1a er første prøve i første episode. 1b er en ny prøve med samme subtype som 1a p
Isolat_nr_MRSA_txt Tekst oversættelse af Isolat_nr_MRSA. Findes kun I arkiveringsversionen
Anmeldesespligtigt_MRSA_isolat_modtaget_dato Dato hvornår isolatet blev modtaget i laboratoriet
MRSA_Løbenr Numerisk, angiver MRSA blankettens løbenr
MRSA_status Internt arbejdsfelt der angiver prøvens status. Ændres løbende eftersom prøven behandles
MRSA_status_Txt Tekst oversættelse af MRSA_status. Findes kun i arkiveringsversionen
GeneXpert Feltet angiver svaret på en analyse der påviser gene mecA
EkstraSvarTil Fritekstfelt der angiver om der er sendt svar til andre end den kliniske mikrobiologiske afdeling, der har sendt prøven ind. Også hvis sådant et svar mangler til nogen der burde have.
Bemærkning_til_isolat Fritekstfelt der indeholder speciel information fra laboratoriet eller kontoret vedr. isolatet. Kan ikke oversættes.
mecA Angivelse af om genet mecA er påvist i isolatet
mecA_Txt Tekst oversættelse af mecA. Findes kun i arkiveringsversionen
Gelnummer_spa_mec Intern arbejdsredskab. Indeholder numeriske værdier. Fortløbende nummer startende med 1. Enkelte isolater er kørt flere gange i analysen, derfor kan der står flere numre, adskilt af +, der betyder ”og” og ikke er en addition
SLIDEX Angivelse af testresultat med agglutinatinstest for mecA
Slidex_Staph_Plus Angivelse af testresultat med agglutinatinstest for Staphylococcus aureus
spa_type Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Beskrives i mikrobiologisk fagsprog. Resultaterne er opbygget på følgende måde: En spatype har altid et "t" som første tegn, efterfulgt af tre til fem cifre. Nummeret er fortløb
spa_repeats Angivelse af resultat af subtypning; hænger sammen med felt spa-type
koagulase Feltet angiver svaret på en analyse (koagulasetest)
koagulase_txt Tekst oversættelse af koagulase. Findes kun I arkiveringsversionen
KNS Feltet angiver om det indsendte isolat er en koagulase-negativ stafylokok, hvilket er en egenskab, der ikke forventes.
KNS_Txt Tekst oversættelse af KNS. Findes kun I arkiveringsversionen
PFGE_gel Angiver hvilken PFGE analyse isolatet er kørt i. Indeholder numeriske værdier. Internt arbejdsredskab, kan ikke oversættes.
CC_gruppe Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Beskrives i mikrobiologisk fagsprog. Resultaterne er opbygget på følgende måde: Først CC, efterfulgt af en til tre cifre.
MRSA_svar_sendt_dato Dato for hvornår svar på indsendt MRSA prøve er sendt
Midlertidig_svar_sendt Dato for hvornår midlertidigt svar er sendt
ccrA_B Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Beskrives i mikrobiologisk fagsprog. Feltet kan antage fire værdier: ccr2, ccr4, ccrC og 5. Værdien 9 og tomt felt betyder ikke udført analyse. Kun udført på ganske få isolater
mec_class Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Beskrives i mikrobiologisk fagsprog. Feltet kan antage fire værdier: classA, classB, classC og C2. Værdien blank og tomt felt betyder ikke udført analyse. Kun udført på ganske f
SCCmec_Oliveira Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Beskrives i mikrobiologisk fagsprog. Feltet kan antage to værdier: I og IV. Tomt felt betyder ikke udført analyse. Kun udført på ganske få isolater
SCCmec_Kondo Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Beskrives i mikrobiologisk fagsprog. Feltet kan antagefølgende værdier: V, IVa, IV + ccrC, IV, III, II, I, ccrC+mecC, ccrC, ccrAB2, ccr2+mecB, ccr2+ccrC+mecB, ccr2, 5, 4a, 3. To
SccMec_konklusion Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Beskrives i mikrobiologisk fagsprog. En oversigt over de mulige resultater kan findes her: https://jarbb.jp/joomla/index.php/en/sccmmcc-list-smn-en. Kun udført på ganske få isol
SIRU Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Beskrives i mikrobiologisk fagsprog. Resultaterne er opbygget på følgende måde: angives som 6 tal, adskilt af bindestreger. Udført på ganske få isolater.
TSS Angiver resultat af undersøgelse for genet tss. Antager værdierne positiv eller negativ
TSS_Txt Tekst oversættelse af TSS. Findes kun I arkiveringsversionen
eta Angiver resultat af undersøgelse for genet eta
etb Angiver resultat af undersøgelse for genet etb
Pvl Angiver resultat af undersøgelse for genet pvl
Pvl_Txt Tekst oversættelse af pvl. Findes kun I arkiveringsversionen
År Angiver det årstal hvorfra prøven stammer. Ikke brugt siden 2011
Dublikat_fag_nr Feltet henviser til en prøve fra samme patient, samme dag, som er en dublet. Femcifret tal henviser til feltet Fagnummer, som er dubletten
Fagnr_primær_isolat Feltet henviser til en prøve fra samme patient, samme dag, som er den primære prøve. Femcifret tal henviser til feltet Fagnummer, som er den primære prøve
FAGTYPNING_betaling Angiver om der skal betales for fagtypningsanalysen
FAGTYPNING_betaling_txt Tekst oversættelse af FAGTYPNING_betaling. Findes kun i arkiveringsversionen
MecA_betaling Angiver om der skal betales for mecA analysen
MecA_betaling_txt Tekst oversættelse af MecA_betaling. Findes kun i arkiveringsversionen
PFGE_betaling Angiver om der skal betales for PFGE analysen
PFGE_betaling_txt Tekst oversættelse af PFGE_betaling. Findes kun i arkiveringsversionen
Toxin_betaling Angiver om der skal betales for toxin analysen
Toxin_betaling_txt Tekst oversættelse af Toxin_betaling. Findes kun i arkiveringsversionen
toxin_profil Angivelse af den samlede toxinprofil. Kun anvendt for få isolater
toxin_profil_txt Tekst oversættelse af toxin_profil. Findes kun i arkiveringsversionen
Resistensbest Angivelse af hvorvidt der skal laves resistensbestemmelse på isolatet
Resistensbest_txt Tekst oversættelse af Resistensbest. Findes kun i arkiveringsversionen
Spa_betaling Angiver om der skal betales for spa analysen
Spa_betaling_txt Tekst oversættelse af Spa_betaling. Findes kun i arkiveringsversionen
Bet1 Angiver hvilken analyse der skal betales for
Bet1_txt Tekst oversættelse af Bet1. Findes kun i arkiveringsversionen
Bet_pvl Angiver om der skal betales for pvl analysen
Bet_pvl_txt Tekst oversættelse af Bet_pvl. Findes kun i arkiveringsversionen
Bet_SIRU Angiver om der skal betales for SIRU analysen
Bet_SIRU_txt Tekst oversættelse af Bet_SIRU. Findes kun i arkiveringsversionen
Klar_til_svar Feltet angiver, hvorvidt prøvesvaret er klar til at blive svaret ud til rekvirenten.
Klar_til_svar_txt Tekst oversættelse af Klar_til_svar. Findes kun i arkiveringsversionen
Svar_skriftlig Angiver om der skal sendes skriftligt svar
Svar_skriftlig_txt Tekst oversættelse af Svar_skriftlig. Findes kun i arkiveringsversionen
CC_seq Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Beskrives i mikrobiologisk fagsprog. Resultaterne er opbygget på følgende måde: Først CC, efterfulgt af en til tre cifre.
CC_PFGE Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Beskrives i mikrobiologisk fagsprog. Resultaterne er opbygget på følgende måde: Først CC, efterfulgt af en til tre cifre.
Plade_seq Internt arbejdsfelt der angiver identifikation af hvilken plade blodisolatet er sendt til sekvenering med. Alfanumerisk
VISA Felt der angiver resultat af VISA analysen. Alfanumerisk. Kun anvendt til ganske få poster
MLST Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Beskrives i mikrobiologisk fagsprog. Resultaterne er opbygget på følgende måde: angives som "ST" plus 1-4 cifre. Felt der angiver resultat af MLST analyse. Kun brugt for yderst
MRSA_anmrykker Alfanumerisk felt, der angiver hvornår der er sendt en rykker for MRSA anmeldelse
Bet_enttox Felt der angiver om der skal betales for enterotoxinanalyse
Bet_enttox_txt Tekst oversættelse af Bet_ettox. Findes kun i arkiverings versionen
Bet_stafart Felt der angiver om der skal betales for artsidentifikation af stafylokok
Bet_stafart_txt Tekst oversættelse af Bet_stafart. Findes kun i arkiveringsversionen
Bet_aur_konf Felt der angiver om der skal betales verifikation af Staphylococcus aureus
Bet_aur_konf_txt Tekst oversættelse af Bet_aur_konf. Findes kun i arkiveringsversionen
mecA_Iga251 Felt der angiver resultat af mecA-lga251 analyse
mecA_Iga251_Txt Tekst oversættelse af mecA_iga251. Findes kun I arkiveringsversionen
Aggregering_1_5 Kolonnen indeholder analysesvar/prøveresultater for ”Typning af MRSA prøver”. Oversættelse: 1=ingen aggregering, 2=svag aggregering, 3=nogen aggregering, 4= en delm aggregering, 5= meget aggregering. Resultat af aggregeringsanalyse, udført på nogle få hun
Aggregering_1_5_txt Tekst oversættelse af Aggregering_1_5. Findes kun I arkiveringsversionen.
tetK Resultat af tetK analyse
tetM Resultat af tetM analyse
scn Resultat af scn analyse
MALDI_TOF_ID Resultat af MALDI-TOF analyse. Alfanumerisk felt
Alt_spa_1084_1618 Resultat af alt spa 1084-1618 analyse
Alt_spa_239_1717 Resultat af Alt spa 239-1717 analysen
sau_hsdS1_CC398_PCR Resultat af sau-hsdS1 CC398 PCR
NGS angiver hvor prøven er sekventeret
NGS_Txt Tekst oversættelse af NGS. Findes kun I arkiveringsversionen
WGS_status Status for prøven sendt til WGS (Whole Genome Sequencing)
WGS_Status_txt Tekst oversættelse af WGS_Status. Findes kun I arkiveringsversionen
WGS_sti Sti hvor WGS data findes
WGSdato Dato for kørsel af WGS
RegningSendt Dato for udsendelse af regning for WGS