Den danske human immundefekt virus sekvensdatabase (2006-2014)
Alias:
Den Danske HIV Sekvens database
Formål
?
Registrering af prøver fra både nysmittede HIV patienter samt HIV patienter i behandling med antiretroviral terapi. Registreringen sker med henblik på at overvåge udviklingen i resistens blandt ny diagnosticerede HIV patienter og som kvalitetskontrol af sekvenser for HIV patienter i behandling.
Indhold
?
Prøver fra HIV inficerede patienter.
Den central variabel i systemet er prøven. Prøvenummeret er unikt og prøver, der starter med ”PT” (f.eks PT6000) er fra HIV patienter i antiretroviral behandling mens prøver, der starter med ”Sero” (f.eks. Sero4000) er fra ny-diagnosticerede HIV patienter.
Dokumentation
?
- Rigsarkivets afleveringsbestemmelse
- Sero-projektet
- Genotypisk resistensbestemmelse af HIV-1
- Resistens bestemmelse af HIV-1 integrase resistens
- Bestemmelse af HIV-1 V3 tropisme
- Eksempel på svarsedler
- Manual til Bionumerics
- Diagram over systemet
- Brugervejledning for HIVDB programmet
- Oversigt over de gældende resistensmutationer i protease, reverse transcriptase og integrase generne
- Tabel med gældende (marts 2016) scoringer for både enkelte og kombinationer af resistensmutationer
- Oversigt over de historiske ændringer i scoringen af de forskellige resistensmutationer
- Baggrundslitteratur om HIV-1 tropisme analysen
- Hjælpedokoument til selve HIV-1 tropisme analysen
Dækker perioden
?
Fra 01-06-2006 til 31-12-2014.