Formål med KAT er at samle informationen, registerdata, til efterlevelse af lægemiddelloven, specielt i forhold til administration af markedsføringstilladelser for lægemidler i Danmark, tilladelser og inspektion af danske lægemiddelvirksomheder, medicovirksomheder (fabrikanter af medicinsk udstyr), lægemiddelkontrol, administration af medicinpriser til apoteker, leveringsevne, m.m.
Data i KAT finder også anvendelse i blandt andet lægepraksissystemer, FMK, elektroniske patientjournaler (sygehuse), elektroniske omsorgsjournaler (kommuners hjemmepleje), samt i forbindelse med forskning i lægemidler.